Grundlæggende kan reaktionsprocessen for alle kulhydrater syntetiseret af Fischer med alkylglykosider reduceres til to procesvarianter, nemlig direkte syntese og transacetalisering. I begge tilfælde kan reaktionen forløbe batchvis eller kontinuerligt.
Under direkte syntese reagerer kulhydratet direkte med fedtalkoholen og danner det nødvendige langkædede alkylpolyglycosid. Det anvendte kulhydrat tørres ofte før den egentlige reaktion (for eksempel for at fjerne krystalvandet i tilfælde af glukosemonohydrat=dextrose). Dette tørringstrin minimerer sidereaktioner, der finder sted i nærvær af vand.
I direkte syntese anvendes monomeren glukose som et fint partikelformet fast stof. Da reaktionen er en ujævn fast/væske-reaktion, skal det faste stof suspenderes fuldstændigt i alkoholen.
Stærkt nedbrudt glukosesirup (DE>96; DE=Dextroseækvivalenter) kan reagere i en modificeret direkte syntese. Brugen af et andet opløsningsmiddel og/eller emulgatorer (f.eks. alkylpolyglycosid) giver en stabil fin-dråbeformet dispersion mellem alkohol og glukosesirup.
To-trins transacetaliseringsprocessen kræver mere udstyr end den direkte syntese. I det første trin reagerer kulhydratet med en kortkædet alkohol (f.eks. n-butanol eller propylenglycol) og omdannes eventuelt til en blanding. I det andet trin transacetaliseres det kortkædede alkylglykosid med en relativt langkædet alkohol for at danne det ønskede alkylpolyglykosid. Hvis molforholdet mellem kulhydrat og alkohol er det samme, er den oligomerfordeling, der opnås i transacetaliseringsprocessen, stort set den samme som den, der opnås i den direkte syntese.
Hvis der anvendes oligo- og polyglykoser (f.eks. stivelse, sirupper med en lav DE-værdi), anvendes transacetaaliseringsprocessen. Den nødvendige depolymerisering af disse udgangsmaterialer kræver temperaturer på >140 ℃. Afhængigt af den anvendte alkohol kan dette skabe tilsvarende højere tryk, som stiller strengere krav til udstyret og kan føre til højere anlægsomkostninger. Generelt er produktionsomkostningerne for transacetaaliseringsprocessen ved samme kapacitet højere end ved direkte syntese. Ud over de to reaktionstrin skal der sørges for yderligere lagerfaciliteter samt valgfrie arbejdsfaciliteter til kortkædede alkoholer. På grund af særlige urenheder i stivelse (såsom proteiner) skal alkylglykosider gennemgå yderligere eller finere raffinering. I en forenklet transacetaaliseringsproces kan sirupper med et højt glukoseindhold (DE > 96%) eller faste glukosetyper reagere med kortkædede alkoholer under normalt tryk, og der er udviklet yderligere processer på dette grundlag. (Figur 3 viser begge synteseruter for alkylpolyglykosider)